Помимо Космического Десанта, Имперской Гвардии и Сестёр Битвы, Империум Человечества располагает также и другими специализированными военными соединениями, предназначенными для борьбы с врагом.
Это - герои Империума, бойцы-одиночки, сопровождающие армии Империума Человечества в их выступлениях против врага и выполняющие специфические задачи, назначенные Адептус Министорум или лично Императором.
Роль таких воинов отводится высокопоставленным должностным лицам Инквизиции, членам Епархиата, а также таинственным представителям Оффицио Ассассинорум (Officio Assassinorum) - убийцам.

Цель Всегда Оправдывает Средства

Наиболее опытные и сильные Имперские Агенты принадлежат к одной из самых малочисленных организаций - Инквизиции. Несмотря на малочисленность адептов, Инквизиция широко известна среди народов Империума Человека. Цель Инквизиции - остановить любую угрозу Империуму, будь то внешняя или внутренняя угроза со стороны еретиков, пораженных хаосом или нелюдей.
Адепты Инквизиции имеют большой выбор средств для достижения своих целей. Если никакие доводы не помогают священникам Инквизиции обратить на свою сторону заблудшие души - в ход идет оружие, приносящее освобождение от скверны Хаоса сошедшим со светлого пути служения Единой Церкви Империума Человека. Иногда ситуация складывается таким образом, что целая планета оказывается обращенной на свою сторону Темными Богами варп-пространства. В таких случаях высшие чины Инквизиции отдают приказ привести в исполнение директиву Экстерминатус (Exterminatus) - орбитальная бомбардировка планеты ядерными зарядами большой мощности, приводящая к полному уничтожению любых проявлений жизни и, иногда, к разрушению самой планеты.
Инквизиторы - адепты Инквизиции, свободно передвигающиеся по просторам Империума Человечества, призванные решать проблемы, уничтожая источник их возникновения. Инквизитор не подчиняется никому, кроме вышестоящих чинов Инквизиции, и, как правило, всегда действует в одиночку. Если миссия не может быть выполнена с использованием лишь хитрости и ума, то Инквизитор не остановится перед применением грубой силы.
На поле битвы Инквизитор может принять командование над любым подразделением, которое он сочтет подходящим для выполнения поставленной перед ним задачи или для уничтожения препятствия, мещающего его работе. Чем больше и опасней угроза - тем больше и мощнее армия, сосредотачиваемая под бдительным руководством Инквизитора.
В то время как провинциальные или планетарные губернаторы не попадают в сферу наблюдения Инквизитора, более мелкие чиновники могут вызвать к себе интерес - Инквизитор всегда бдительно следит в ходе своих расследований за любыми проявлениями психокинеза.  Ужасная угроза, которую представляют собой псайкеры изменники в 41-ом тысячелетии, является причиной того, что Инквизиторы часто призываются на планеты Империума для уничтожения культов Хаоса или проникающих порой в миры Империума демонических созданий из варп-пространства.

Молитесь Императору, ибо ОН - Наше Спасение! 

Миссионеры, Проповедники и Исповедники Адептус Министорум (Единая Церковь Империума Человека) принимают участие в сражениях на полях битв по всей галактике, где они вдохновляют отряды, лояльные Императору, своими проявлениями стойкости духа и военными навыками. Проповедники и Исповедники используют Святое Слово Министорума, направляя с вдохновенным красноречием действия защитников Империума. Миссионеры - опытные ветераны многих войн, нашедшие себя в лоне Единой Церкви, они распространяют догматы Министорума и Имперское Кредо на пограничных мирах Империума, оттачивая свои боевые и ораторские навыки в наиболее суровых и неприветливых условиях окраинных планет.
Имперские Агенты сражаются с ересью и силами Хаоса по всей галактике, возглавляя чаще всего силы Имперской Гвардии или Сестер Битвы, нежели Ордены Космического Десанта.

Бойся Меня! Я - Твой Апокалипсис!

Иногда кинжал в темноте более эффективен, чем тысяча мечей на рассвете. Это высказывание может служить объяснением факту существования агентов Оффицио Ассассинорум. Оффицио Ассассинорум разделен на несколько Храмов, каждый из которых воспитывает своих адептов в каком-то определенном способе устранения цели.
Храм Vindicare сосредоточен на воспитании в своих адептах терпения и меткости. Ассасин Vindicare, вооруженный снайперской винтовкой "Exitus", может ждать в течение дней, пока его жертва не потеряет бдительность или не покажется из укрытия. Цель имперских Ассасинов Vindicare - уничтожение угрозы Империуму одним безошибочным выстрелом. Методы Ассасинов Vindicare не таят в себе никаких хитростей, но мастерство Ассасина таково, что уже само имя "Vindicare" внушает страх даже лояльным гражданам, не говоря уже о врагах Империума. Ни один лидер Культа Хаоса, ни один мятежный губернатор не может быть уверен в том, что в любой момент не вылетит из ночи пуля с высеченным на ней именем!
Ассасины Каллидус (Callidus) специализируются в скрытном проникновении в помещения и маскировке. Используя наркотик "полиморфин" (рolymorphine), Ассасин Каллидус изменяет свою внешность до такой степени, что его жертва не может заподозрить ничего вплоть до момента смерти.
Ассасины Храма Эверсор (Eversor) специализируются в тактике устрашения и физического уничтожения противника в ближнем бою. Продукт использования смертельной комбинации боевых наркотиков, биоинженеринга и психотической ярости. Ассасин Эверсора - безумный боевой монстр, которого ничто не может остановить!
Последняя и наиболее таинственная секта Оффицио Ассассинорум - Храм Калексус (Culexus). Каждый Ассасин Калексуса - это индивидуум с врожденным генетическим дефектом, который наблюдается у одного человека из миллиарда. Это - уникальная страшная психокинетическая аура, подавляющая все существа вокруг генного носителя и блокирующая любые проявления телепатии или психокинетики, кроме тех, что совершает сам носитель дефектного гена. Подобные уникальные способности позволяют использовать Ассасина Калексуса для обнаружения и уничтожения телепатов и психокинетиков, попавших под влияние Хаоса, или самих Тамплиеров Хаоса.